真核生物的基因組相當于基因的一股由只有一個復制DNA序列（也稱單一DNA，unique sequence，single copy seqence，nonrepetitive sequence等）和具有多數反復存在的DNA順序組成。稱后者為重復順序。組成基因組的DNA順序，根據其重復的頻度可分為三類。一是基因組只有一個復制順序的單一DNA，二為高度重復順序（highly repetitivesequence），由較短的順序10⁵—10⁷次直線連結而成，其中含隨體DNA等。第三為中等程度的重復順序（moderately repetitive sequence），為有300—500個核苷對的大致相同的順序——例如在將哺乳類的DNA用限制酶AluI（AG↓CT）切斷時所產主的主要片斷中所見到的高頻率（10⁵）的順序（AluIfamily）——與單一DNA一起分散存在的，以及像核糖體RNA基因或組蛋白基因群那樣的多次成直線相連存在的（多基因群）都包含在這一類中。此外有在反方向上重復的順序（inverted repetitive seq－uence），其變性DNA折疊成發夾結構（hairpinstructure，foldback structure，snapback stru－cture），在編碼分析中可迅速再結合的類型。